Najviac ocenení, teda dve si odniesol britský spevák James Blunt s videoklipom You're Beautiful, rovnako ako britské duo Gnars Barkley a videoklip Crazy. Medzi ženami bodovala Kelly Clarkson s videoklipom Because Of You. Najlepším videoklipom skupiny je Move Along od kapely All-American Rejects.
| ZOZNAM OCENENÝCH NA MTV VIDEO MUSIC AWARDS 2006: | |
| Najlepší videoklip roka | Panic! At The Disco – I Write Sins Not Tragedie |
| Najlepší ženský videoklip roka | Kelly Clarkson – Because of You |
| Najlepší mužský videoklip roka | James Blunt – You're Beautiful |
| Najlepší videoklip skupiny | All-American Rejects – Move Along |
| Najlepší rapový videoklip | Chamillionaire featuring Krayzie Bone – Ridin' |
| Najlepší r'n'b videoklip | Beyoncé featuring Slim Thug & Bun B – Check On It (Pink Panther) |
| Najlepší hip-hopový videoklip | Black Eyed Peas – My Humps |
| Najlepší tanečný videoklip | Pussycat Dolls featuring Snoop Dogg – Buttons |
| Najlepší rockový videoklip | A.F.I. – Miss Murder |
| Najlepší popový videoklip | Pink – Stupid Girls |
| Najlepší videoklip nováčika | Avenged Sevenfold – Bat Country |
| Viewer's Choice | Fall Out Boy – Dance, Dance |
| Réžia | Robert Hales za videoklip: Gnarls Barkley – Crazy |
| Choreografia | Sho-tyme za videoklip: Shakira featuring Wyclef Jean – Hips Don't Lie |
| Špeciálne efekty | Louis Mackall za videoklip: Missy Elliott – We Run This |
| Výprava | Justin Dragonis za videoklip: Red Hot Chili Peppers – Dani California |
| Strih | Ken Mowe za videoklip: Gnarls Barkley – Crazy |
| Kamera | Robbie Ryan za videoklip: James Blunt – You're Beautiful |
| Najlepší soundtrack videohry | Marc Ecko's Getting Up (Atari) |
| Najlepšia hudba videohry | Elder Scrolls IV: Oblivion (Jeremy Soule) |
| Najlepšie telefónne zvonenie roka | Fort Minor – Where'd You Go |
